《新宿天鹅2》剧情简介：被害的真纪的因为钱包不见了，被疑为是强盗杀人。乍看之下虽然像是强盗杀人，柯南却肯定凶手是这些大学生一行人中的某人。虽然怀疑藤浩的不在场证明是否可以确立，这时这一行人中复杂的人际关系一点一点浮现出来。这次的杀人事件中，隐藏着另外一个邪恶的计划。在“沉睡的小五郎”的解说下凶手最终浮出水面来。